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背景 基于临床数据和治疗方案的机器学习,以更好地做出临床决策,是当前研究的热点。本研究旨在构建一个关于溃疡性结肠炎(UC)的洗涤菌群移植(WMT)的机器学习模型,为患者和临床医生提供一个新的评估系统,以优化临床决策。 方法 招募了2013年4月至2022年6月在南京医科大学附属医院通过中肠或结肠输送途径接受WMT的UC患者。基于临床指标的模型合奏是通过机器学习构建的,以预测WMT治疗后一个月后的临床反应。 结果 这项研究共有366名患者,其中210名患者被分配进行培训和内部验证,156名患者进行外部验证。间接胆红素水平低、激活抗凝血酶III、排便频率和胆碱酯酶以及老年人和肌酸激酶、HCO3-和凝血酶时间水平高,与一个月后WMT的临床反应有关。此外,投票合奏在内部验证中显示曲线下面积(AUC)为0.769 ± 0.019 [准确度,0.754;F1-score,0.845];外部验证的AUC为0.614 ± 0.017 [准确性,0.801;F1-score,0.887]。此外,该模型可在https://wmtpredict.streamlit.app上找到。 结论 这项研究开创了机器学习模型的开发,以预测WMT在UC上的一个月临床反应。这些发现展示了机器学习应用在WMT领域的潜在价值,为胃肠道疾病的个性化治疗策略开辟了新途径。 引文:Zhang S, Lu G, Wang W, Li Q, Wang R, Zhang Z, Wu X, Liang C, Liu Y, Li P, Wen Q, Cui B, Zhang F. A predictive machine-learning model for clinical decision-making in washed microbiota transplantation on ulcerative...

背景与目的: 维生素D(Vitamin D, VD)缺乏与溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)的活动度及严重程度相关。肠道菌群被认为是UC发生发展中的重要因素,而 VD代谢与肠道菌群相互影响。本研究旨在探讨洗涤菌群移植(Washed microbiota transplantation, WMT)对UC患者VD代谢的影响。 方法: 纳入UC患者以及匹配的健康对照人群,通过检测血清25-羟基维生素D(25 hydroxyvitamin D,25(OH)D)浓度,评估UC患者血清VD水平。随后,进行了一项非随机对照试验(非RCT)。UC患者被非随机分配接受WMT(n=28)和常规治疗(5-氨基水杨酸,5-ASA,n=10)。治疗前和治疗后3个月,评估UC患者的血清25(OH)D水平、粪便宏基因组和维生素D受体(vitamin D receptor,VDR)表达。 结果: 本研究检测了121名UC患者及53名HC血清25(OH)D水平,UC患者VD水平明显低于HC(p<0.001)。在非随机对照试验中,WMT组的血清25(OH)D水平和VDR表达显著增加(分别为p=0.011和0.026),而非WMT组未见明显变化。宏基因组分析显示,WMT后VD水平的增加与Adlercreutzia_equolifaciens菌、瘤胃球菌(Ruminococcus_obeum) 和多尔氏菌(Dorea)的丰度呈正相关,与大肠杆菌(Escherichia)呈负相关。 结论: 本研究表明,WMT改变特定菌群的丰度而增加血清VD水平,提示VD水平与UC活动度之间的关联可能受到肠道菌群的调节。 Reference:Zhang H, Xiao Y, Wen Q, Zhang S, Li P, Marcella C, Hu B, Liu H, Zhang F, Cui B. Washed microbiota transplantation improved the level of serum vitamin D in ulcerative...

2024年8月本团队在内镜领域国际顶刊《Endoscopy》首次报道经内镜肠道植管术(TET)靶向回肠给药解除小肠巨大粪石嵌顿,这是TET技术在Endoscopy发表的第三篇论文。该论文题目为“Successful management of fecalith impaction in the distal ileum using a transendoscopic enteral tube for targeted drug delivery”。研究报道了一名69岁男性因“腹痛、腹胀一周,伴恶心呕吐一天”就诊。CT显示远端小肠壁增厚狭窄,狭窄口上方见一直径约3.4×2.8 cm的腔内高密度影,近段肠道扩张伴气液平,予以补液、灌肠以及口服泻药通便等保守治疗,症状无好转。肠道超声提示远端回肠仍有强回声团块。考虑诊断:回肠粪石嵌顿、回肠狭窄、不全性肠梗阻。患者行小肠镜检查,尝试内镜下取出异物。镜下发现距回盲瓣约40cm远端回肠见黑色粪石嵌顿,粪石周围可见环形溃疡伴狭窄。术中尝试球囊导管辅助取石和钬激光碎石术,但由于粪石的特性及肠道狭窄,均未成功。炎性溃疡性狭窄行内镜下狭窄切开和扩张亦存在较大风险。最终,在粪石下方放置TET管拟靶向回肠给药。术后经TET予地塞米松(10mg/d*3d)灌肠治疗炎性狭窄。三天后复查CT显示远端回肠炎症明显改善,粪石已移至近回盲瓣附近。为促进粪石排出,经TET注入了泛影葡胺溶液。一天后患者成功排出粪石。患者术中及术后均未出现并发症。本案例经TET靶向回肠给药成功治疗远端回肠粪石嵌顿,避免了外科手术,对于远端回肠粪石梗阻的治疗或许具有特殊的价值和意义。 图 1 Computed tomography revealed distal small intestinal wall thickening with a 3.4 × 2.8 cm high-density intraluminal foreign body (red arrow). a Transverse plane. b Coronal plane. 图 2  A black...

系统性硬化病(systemic sclerosis, SSc),是一种以皮肤增厚和纤维化为特征的慢性自身免疫病,可能累及多器官多系统。近期研究发现,SSc患者常出现肠道菌群紊乱,提示肠道菌群可能参与SSc发病与进展过程。洗涤菌群移植可重建肠道微生态,达到治疗肠内、肠外疾病的作用。本文报道1例SSc伴严重腹痛、腹胀、腹泻等消化道症状的诊疗决策过程和长期随访结果,并强调微生态医学的临床思维在个体化诊疗策略中的重要性。 Reference:梁晨晨,温泉,张发明. 洗涤菌群移植治疗系统性硬化病1例[J]. 中华风湿病学杂志,2023,27(12):829-832. DOI:10.3760/cma.j.cn141217-20230529-00146 第一作者:梁晨晨 通讯作者:张发明...

一名50岁男性,有15年克罗恩病(CD)病史,因腹胀加重1周紧急入院。在前3个月,他接受了完全肠内营养。尽管接受了禁食和胃肠减压等对症治疗,但腹胀仍然存在。计算机断层扫描显示回肠末端狭窄,长度为60mm,不适合内镜切开或球囊扩张。清洁灌肠后进行结肠镜检查以进一步评估肠道状况,并进行结肠途径经内镜肠道植管术(TET)以解决梗阻。 结肠TET有多种用途,用于管理整个结肠的各种疾病,包括粪菌移植、药物结肠给入和内镜检查相关穿孔的减压。在这种情况下,结肠TET被创新地用于肠梗阻后的减压。TET管成功穿过导致阻塞的针孔样狭窄。在结肠TET穿过狭窄处后立即开始减压,患者耐受性良好。这种干预迅速缓解了患者的腹胀,导致腹部变平。在11天内,共有8135mL肠液通过TET管引流出,为后续治疗创造了有利条件。经充分的术前治疗后,患者成功接受了右结肠和末端回肠切除术。术后,TET管在肠道内放置了1周,继续引流减压,避免术后感染,促进伤口愈合。 Reference: Yu Y, Zhang F, Cui B. Innovative management of intestinal obstruction with colonic transendoscopic enteral tubing. Endoscopy. 2023 Dec;55(S 01):E1207-E1208. doi: 10.1055/a-2199-4663. Epub 2023 Nov 21. https://doi.org/10.1055/a-2199-4663...

粪菌移植(FMT) 已成为一种很有前途的治疗菌群失调相关疾病的方法。然而,手工粪菌移植的临床实践在可接受性和可重复性方面存在局限性。因此,发展了FMT的两种替代解决方案:移植细菌或病毒组。先进的移植细菌的方法主要包括洗涤菌群移植和细菌孢子疗法。随着粪便病毒组的发展,还探索了病毒组移植,这涉及从粪便中过滤出病毒组。这些方法为患者和医疗保健提供者提供了更可接受的选择,同时最大限度地减少了研究异质性。总的来说,全球趋势中下一代 FMT的发展是粪便微生物群中特定成分的移植,主要集中在移植细菌或病毒组。 Reference: Yu Y, Wang W, Zhang F. The Next Generation Fecal Microbiota Transplantation: To Transplant Bacteria or Virome. Adv Sci (Weinh). 2023 Dec;10(35):e2301097. doi: 10.1002/advs.202301097. Epub 2023 Nov 1. https://doi.org/10.1002/advs.202301097...

艰难梭菌感染(Clostridioides difficile infection,CDI)是抗生素相关性腹泻的主要原因,其临床表现从轻度腹泻到重度暴发性结肠炎、中毒性巨结肠,甚至死亡。抗生素作为一线治疗,对于初发CDI的有效率大概在80%左右,也就是说每5人中就有1人对抗生素无效。而抗生素对于复发性CDI的有效率更加有限。抗生素耐药及抗生素所致菌群失调的恶化是抗CDI治疗失败和复发的主要原因。...

《Progress in Neuropsychopharmacology & Biological Psychiatry》近日发表了一篇来自本团队有关“洗涤菌群移植对于肠易激综合征患者胃肠道症状及肠外症状疗效”的临床研究。该研究评估了洗涤菌群移植(WMT)对于IBS患者胃肠道症状及精神心理症状(睡眠、焦虑、抑郁)的疗效,重点分析了睡眠质量的改善及影响因素。...

本研究利用液相色谱质谱联用(liquid chromatography–mass spectrometry,LC-MS)的非靶向代谢组学技术,评估广泛难治性溃疡性结肠炎患者接受粪菌移植治疗前后血清代谢谱的变化,并鉴定出与临床缓解相关的潜在代谢物。本研究为今后定量测定所鉴定的生物标志物、进而及时预测粪菌移植的疗效提供参考,为建立高性能的人工智能评价模型奠定基础。...

新兴的微生态技术,特别是微生物组测序技术、多组学整合挖掘技术和粪菌移植新方法,这些技术所诊疗的疾病跨越多个传统学科,已经推动医学的变革性发展。然而,如果按照当前的形式去利用、推广和发展这些微生态技术,整个领域将面临临床医学学科构架制约的问题,同时,技术思维和技术的功利性行为,还可能反过来为技术发展制造陷阱。新的临床医学学科构架可望解决这些瓶颈问题,并回避这些陷阱。本文旨在以医学发展的本质需求,定义微生态医学的学科概念和维度,构建新的临床医学学科,去发展其理论、医疗技术、医学教育。 关键词: 临床医学;学科;微生物组;微生态医学;洗涤菌群移植 原文链接:微生态医学作为临床医学学科的探讨 doi: 10.7655/NYDXBSS20230113...